PROYECTO QUIMICA ORT DEL GENOMA HUMANO

Investigacion en Bioquimica Molecular y Proteómica 2008

Por cuarto año consecutivo los alumnos del ultimo año de la especialidad Quimica de la escuela ORT Argentina realizaran sus proyectos finales en distintas universidades y centros de investigacion con profesionales reconocidos. La metodologia de trabajo evita la transposicion didactica permitiendo a los estudiantes realizar su actividad final en los lugares donde se esta generando el conocimiento.
La articulacion entre nivel medio y el posgrado es auspiciada por el CONICET (Consejo Nacional De Investigacion Cientifica...).
Los proyectos de investigacion para el año en curso son:

1) Evaluacion de la expresion de la molecula de adhesion Cadherina epitelial en tejidos humanos normales y tumolares.
Investigador:Doctora monica Vazquez-Levin.
Instituto de Biologia y Medicina Molecular ( IBYME-CONICET).
Alumnos: Yael Dobzewicz y Gala Szapiro.
Link: http://www.proyecto-6q.blogspot.com/

2) Accion del Hexaclorobenceno (HCB) sobre la Uroporfirinogeno Decarboxilasa de una linea celular de Hepatocitos humanos. Mecanismo de accion.
Investigador:Doctora Maria del Carmen Rios de Molina.
Instituto: Departamento Quimica Biologica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales.
Alumnos: Lucas Toiw y Uriel Frid.
Link: http://www.proyectofird-toiw08.blogspot.com/

3)Modelos experimentales de enfermedades metabólicas: Porfiria y Síndrome Metabólico. Proteómica y Metabolómica de estos disturbios.
Investigador: Dra. Marta Blanca Mazzetti.
Instituto: Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA). Alumnos: Maria Duperron y Mauro Elencwajg.
Link: http://proyectofinal6q.blogspot.com/

4) Factores no hemodinámicos relacionados con la génesis y evolución de la proteinuria durante la enfermedad renal progresiva.
Investigador: Dra. Elsa Zotta.
Instituto: Laboratorio de Fisiopatogénia, Departamento de fisiología, Facultad de medicina, UBA. Alumnos: Barbara Helueni y Melanie Naiman.
Link: http://proyectoq08.blogspot.com/

5) Estudio de la participacion de la anandamida en la regulacion de la interaccion espermatozoide-ovioducto en un modelo bovino.
Investigador: Dra. Silvina Perez Martinez.
Instituto: Facultad de medicina - UBA
Alumnos: Judith Arenas Tenenbaum y Melina Braverman
Link: http://www.scienceproject08.blogspot.com/

6) El estudio de los mecanismos moleculares involucrados en la regulación del gen UGA4 de Saccharomyces cervisiae en respuesta a cambios en la disponibilidad de nutrientes con el fin de dilucidar las distintas cascadas de señales desencadenadas por dichos nutrientes y establecer sus interconexiones.
Investigador: Dra Susana Correa García.
Instituto: Departamento de Química Biologica, Facultad de ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires.
Alumnos: Iván Mikiej y Victoria Salama
Link: http://www.proyectoquimica22.blogspot.com/

7) Diagnóstico de la enfermedad de Von Willebrand (VWD) tipo 2N por técnicas fenotípicas y genotípicas.
Investigador: Dra. Adriana I. Woods.
Instituto: Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex" de la Academia Nacional de Medicina.
Alumnos: Abigail Skverer y Daniela Lin
Link: http://www.vwd-diagnostico.blogspot.com/

8) Estudio de la mielinogenesis en el sistema nervioso periferico en condiciones fisiologicas y patologicas. Participacion de celulas pluripotentes en el proceso de degeneracion-regeneracion nerviosa.
Investigador: Dra Patricia Setton-Avruj.
Instituto: Dpto de Quimica Biologica, Facultad de Farmacia y Bioquimica (IQUIFIB-UBA-CONICET).
Alumnos: Averbuj Daniel y Eitan Rozenszajn.
Link: http://www.proyectoaverbuj-rozenszajn.blogspot.com/

9) Diseño y desarrollo de vacunas antitumorales empleando bacterias y celulas tumorales modificadas con genes inmunomodiladores. Estudio de los mecanismos inmunes inducidos.
Investigador: Claudia I. Waldner y Claudia Mongini.
Instituto: Laboratorio de inmunologia celular y molecular. Centro de Estudios Farmacologicos y Botanicos (CEFYBO. CONICET-UBA)
Alumnos: Amalia Surijon y Maria Belen Tolava Rivero
Link: http://www.amibeluproyecto.blogspot.com/

10) Marcadores Geneticos Asociados al Cáncer
Investigador: Dr.Javier Hernán Cotignola
Instituto: Laboratorio de Cáncer y Apoptosis del Departamento de Quimica Biologica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de Buenos Aires.
Alumnos: Ayelén Marano y Solange Perchik
Link: http://marcadoresgeneticos.blogspot.com/

11) Expresion del canal de la conductancia transmembranal de la Fibrosis Quistica (CFTR) en placentas Preeclampticas: posible rol en la regulacion de la actividad de la Acuoporina-9 (AQP9).
Investigador: Dr Alicia E Damiano
Instituto: Catedra de Biologia Celular, Departamento de Ciencias Biologicas, Facultad de Farmacia y Bioquimica (UBA)
Alumnos: Gabriel Colodenco y Martín Sapir.
Link: http://proyectofinalcs.blogspot.com/

12) Proteómica de factores secretados por células de cáncer de mama y mama normal con capacidad inhibitoria de la producción lipídica.
Investigador: Dra.Guerra de Grignoli Liliana Noemi
Instituto: Departamento de Ciencias biologicas. Facultad de ciencias exactas y naturales,UBA-CONICET.
Alumnos: Fabiana Durante y Tamara Broitman.
Link: http://tyf-proyecto08.blogspot.com/

13) Neovascularizaciòn en un modelo murino de inflamaciòn aguda inducida por LPS.
Investigador:Eulalia de la Torre.
Instituto: Facultad de Medicina - Uba - Laboratorio de Inmunofarmacologia
Alumnos: Federico Mauas Walach, Pablo Kuleff.
Link: http://www.finalproyectort.blogspot.com/

14) Interacción de sumo-1 y mage-a2 en la regulacion del oncosupresor p53
Investigador: Martín Monte
Instituto: Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA)
Alumnos: Leonel Stermann y Yair Litman
Blog: http://proyectosumo.blogspot.com/

15) Estudio de la Growth Associated Protein (GAP-43), su interacción con la Ubicutina y su participación en el control del ciclo celular en células NIH3T3 transfectadas en forma estable y transiente. Efecto de la Apo-transferrina en la remielización: participación de la vía Notch en la diferenciación oligodendrioglial.
Investigador: Doctora Ana M. Adamo.
Instituto: Departamento de Química Biológica Patológica, Facultad de Farmacia y Bioquímica de la UBA. CONICET.
Alumnos: Rodrigo C. Pampin y Robby Mattes
Link: http://www.gap-43.blogspot.com/

domingo, 17 de agosto de 2008

Semana 10 (17 de Julio)

Nosotros ya teníamos el gel preparado de la semana pasada. Hoy nos encargamos de largar la corrida electroforética propiamente dicha:
Nosotros sabíamos que nuestra cantidad de proteínas por unidad de volumen era:







Entonces sabiendo que se desea sembrar siempre la misma cantidad de proteínas, para que en la corrida, la diferencias esten dadas por las diferente composición de las muestras o las diferentes situaciones experimentales y no por la cantidad sembrada. Entonces de todos estos se siembra solo 40 ug de proteínas. El volumen que se deberá sembrar de cada uno para llegar a los 40 ug será:





Entonces el volumen total de siembra para cada caso será:
Luego a cada uno se le debe agregar un volumen de buffer Laemmli que equivalga a la cuarta parte del volumen de cada muestra; en este caso:


Entonces el volumen total de siembra para cada caso será:



Una vez hecho esto se lleva a ebullición para desnaturalizar por completo a las proteínas, y de esta forma asegurarse que las diferentes bandas que vayan a dar en la electroforesis se deba al peso molecular de la proteína y no a su forma globular u otra estructura terciaria que haga que el resultado en verdad difiera. Las proteínas deben tener únicamente su estructura primaria, es decir, su cadena extendida de aminoácidos, la cadena polipeptídica.

Habiendo realizado los pasos previos, introdujimos el gel en la cuba electroforética para la posterior realización de la corrida.

El gel esta armado de tal manera que nos quedan 4 calles con la siembra de nuestras 4 muestras y la primera calle con el marker (mezcla de proteínas con peso molecular conocido, del cual se siembran solo 5 ul):





El voltaje inicial con el cual se debe comenzar la electroforesis es de 50 V. Luego de que la corrida haya pasado el Stacking, el voltaje se cambia a 100V
Lamentablemente no pudimos sacar una foto del gel listo, sin embargo un dibujo de lo observado sería:






Este mismo día operamos 2 animales realizando una compresión nerviosa en cada uno para poder dejarlos 7 días de sobrevida y luego analizar los cambios ocurridos; para esto debimos hacer el mismo procedimiento que con la extracción del nervio pero con el animal vivo, anestesiado y cuidando al esterilidad del proceso para que la injuria sea exitosa, ya que de haber muerto el animal, habría sido en vano.

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